Zone vaste ale genomului uman, considerate mult timp lipsite de utilitate, ar putea indica noi direcții pentru tratamentele împotriva cancerului. O echipă din Australia a creat un instrument care analizează molecule ascunse în aceste regiuni și le leagă de activitatea tumorilor.
Cercetătorii de la Institutul de Cercetări Medicale QIMR Berghofer s-au concentrat pe ARN-ul lung necodificator, cunoscut sub abrevierea lncRNA. Deși nu produce proteine, acest tip de ARN poate influența modul în care funcționează genele și celulele canceroase.
Pentru a urmări rolul acestor molecule, echipa a combinat analiza țesuturilor la nivel celular și spațial cu modele matematice și metode de calcul. Studiul a folosit probe provenite de la 13 tipuri de cancer, printre care forme ale bolii localizate la sân, creier, intestin și piele.
În total, au fost identificate 219.442 de molecule lncRNA candidate. Dintre acestea, 94.795 nu fuseseră descrise anterior, iar multe au fost evidențiate ca posibili candidați cu rol funcțional în dezvoltarea tumorilor.
Atlasul care cartografiază tumorile
Cercetătorii au stabilit poziția tridimensională a fiecărei molecule în țesut și în celulele canceroase. Instrumentul arată și legăturile acestora cu alte celule, gene și molecule, precum și zonele exacte din tumoră în care se desfășoară activitatea observată.
Datele au fost reunite în SPanC-Lnc, un atlas interactiv disponibil public. Echipa QIMR Berghofer îl descrie drept cea mai amplă resursă de acest tip, destinată comunității științifice internaționale.
Profesorul asociat Quan Nguyen, autorul principal al cercetării, a explicat că atlasul poate sprijini identificarea unor noi biomarkeri și a unor posibile ținte pentru terapii de precizie împotriva cancerului. Rezultatele studiului au fost publicate în revista Nature Methods.
Următoarea etapă este verificarea experimentală a fiecărei descoperiri legate de lncRNA. Prin aceste teste funcționale, cercetătorii vor încerca să stabilească ce molecule au cel mai mare potențial pentru viitoare metode de diagnostic și tratament.
